Ion Petre - UTU Tutkimustietojärjestelmä - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Ion Petre

- professori,
matematiikka (matematiikan ja tilastotieteen laitos)

Department of Mathematics and Statistics

ion.petre@utu.fi

Työhuone: 367

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-5014-5529

Petre_CV January 2023 full.pdf

Homepage

YouTube

Asiantuntijuusalueet

Discrete mathematics; theoretical computer science; complex systems; data science; computational systems biology; machine learning

Julkaisut

3/9

Structural target controlability of linear networks (2018)
- IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
Eugen Czeizler, Cristian Gratie, Wu Kai Chiu, Krishna Kanhaiya, Ion Petre
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Systems Biology Analysis Identifies Targetable Vulnerability Networks to Proteasome Inhibitors in Multiple Myeloma (2018)
- Blood
Meads Mark B., Renatino Canevarolo Rafael, Sudalagunta Praneeth Reddy, Oliveira Paula S., Magaletti Dario M., Fang Bin, Silva Maria D Coelho Siqueira, Kulkarni Amit, Dai Hongyue, Dalton William S., Petre Ion, Koomen John M., Silva Ariosto Siqueira and Shain Kenneth H.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
WEBRSIM: A web-based reaction systems simulator (2018) Enjoying Natural Computing Ivanov Sergiu, Rogojin Vladimir, Azimi Sepinoud, Petre Ion
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
A Foundational Framework for Step-by-step Model Construction (2017)
- Fundamenta Informaticae
Barash Mikhail, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Magician in Science. Liber Amicorum Grzegorz Rozenberg (2017) Azimi Sepinoud, Hoogeboom Hendrik Jan, Kleijn Jetty, van der NatMarloes , Petre Ion, Salomaa Arto
(C2 Toimitustyö tieteelliselle kokoomateokselle)
At the Intersection of Computer Science with Biology, Chemistry and Physics – In Memory of Solomon Marcus (2017)
- Theoretical Computer Science
Paun Gheorghe, Petre Ion, Rozenberg Grzegorz, Salomaa Arto
(C2 Toimitustyö tieteelliselle kokoomateokselle)
Controlling Directed Protein Interaction Networks in Cancer (2017)
- Scientific Reports
Kanhaiya Krishna, Czeizler Eugen, Gratie Cristian, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Multi-Stability, Limit Cycles, and Period-Doubling Bifurcation with Reaction Systems (2017)
- International Journal of Foundations of Computer Science
Azimi Sepinoud, Panchal Charmi, Mizera Andrzej, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Reaction systems: a model of computation inspired by the functioning of the living cell (2017) The Role of Theory in Computer Science Ehrenfeucht Andrzej, Petre Ion, Rozenberg Grzegorz
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Stepwise construction of a metabolic network in Event-B: the heat shock response (2017)
- Computers in Biology and Medicine
Sanwal Usman, Petre Luigia, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Tailored approaches in drug development and diagnostics - from molecular design to biological model systems (2017)
- Advanced Healthcare Materials
Sahlgren Cecilia; Meinander Annika; Zhang Hongbo; Cheng Fang; Preis Maren; Xu Chunlin; Salminen Tiina; Toivola Diana; Abankwa Daniel; Karaman Didem; Salo Outi; Österbacka Ronald; Eriksson John E; Willför Stefan; Petre Ion; Peltonen Jouko; Leino Reko; Johnson Mark; Rosenholm Jessica; Sandler Niklas
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Unveiling Dynamics and Complexity (2017) Kari Jarkko, Manea Florin, Petre Ion
(C2 Toimitustyö tieteelliselle kokoomateokselle)
Automatic discovery of combined drug therapy (2016) Proceedings of the Thirteenth International Meeting on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics Rogojin Vladimir, Kazemi Keivan, Kanhaiya Krishna, Czeizler Eugen, Petre Ion
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa)
Complete characterization for the fit-preserving data refinement of mass-action reaction networks (2016)
- Theoretical Computer Science
Gratie Cristian, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Complexity of model checking for reaction systems (2016)
- Theoretical Computer Science
Azimi Sepinoud, Gratie Cristian, Ivanov Sergiu, Manzoni Luca, Petre Ion, Porreca Antonio E.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Generating the logicome of a biological network (2016) Algorithms for Computational Biology Panchal Charmi, Azimi Sepinoud, Petre Ion
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa)
Large-scale executable biology using rapid integration of computational models (2016)
- Computer Science Journal of Moldova
Rogojin Vladimir, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Quantitative model refinement in four different frameworks, with applications to the heat shock response (2016) From Action Systems to Distributed Systems: the Refinement Approach Gratie Diana-Elena, Iancu Bogdan, Azimi Sepinoud, Petre Ion
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Target controlability of Linear networks (2016) Proceedings of Computational Methods in Systems Biology Czeizler Eugen, Gratie Cristian, Chiu Wu Kai, Kanhaiya Krishna, Petre Ion
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa)
Target controllability of linear networks (2016)
- Lecture Notes in Computer Science
Computational Methods in Systems Biology, 14th International Conference, CMSB 2016 Czeizler E., Gratie C., Chiu W., Kanhaiya K., Petre I.
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa)