Ion Petre - UTU Tutkimustietojärjestelmä - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Ion Petre

- professori,
matematiikka (matematiikan ja tilastotieteen laitos)

Department of Mathematics and Statistics

ion.petre@utu.fi

Työhuone: 367

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-5014-5529

Petre_CV January 2023 full.pdf

Homepage

YouTube

Asiantuntijuusalueet

Discrete mathematics; theoretical computer science; complex systems; data science; computational systems biology; machine learning

Julkaisut

2/8

Controllability of reaction systems (2020)
- Journal of Membrane Computing
Sergiu Ivanov, Ion Petre
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Journal of Membrane Computing, Volume 2, issue 3, October 2020, Special Issue on Reaction Systems (2020) Mikulski Łukasz, Petre Ion
(C2 Toimitustyö tieteelliselle kokoomateokselle)
Journal of Membrane Computing, Volume 2, issue 3, October 2020, Special Issue on Reaction Systems (Preface) (2020)
- Journal of Membrane Computing
Journal of Membrane Computing: Special Issue on Reaction Systems Mikulski Łukasz, Petre Ion
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Network controllability analysis of three multiple-myeloma patient genetic mutation datasets (2020)
- Fundamenta Informaticae
Jose Angel Sanchez Martin, Ion Petre
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Friendly Towering Figure of Theoretical Computer Science. Liber Amicorum: Arto Salomaa (2019) Juhani Karhumäki, Lila Kari, Hermann Maurer, Gheorghe Paun, Ion Petre, Grzegorz Rozenberg
(D6 Toimitustyö ammatilliselle kokoomateokselle )
Reaction Systems and Synchronous Digital Circuits (2019)
- Molecules
Zeyi Shang, Sergey Verlan, Ion Petre, Gexiang Zhang
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Refinement-based modeling of the ErbB signaling pathway (2019)
- Computers in Biology and Medicine
Bogdan Iancu, Usman Sanwal, Cristian Gratie, Ion Petre
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Systems Biology Approach to Identify Mechanisms of Therapy Resistance in Multiple Myeloma (2018)
- Blood
Canevarolo Rafael Renatino, Sudalagunta Praneeth Reddy, Silva Maria D Coelho Siqueira, Meads Mark B., Granados Priscilla, Berglund Anders, Kulkarni Amit, Dai Hongyue, Dalton William S., Petre Ion, Shain Kenneth H. and Silva Ariosto Siqueira
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
NetControl4BioMed: A pipeline for biomedical data acquisition and analysis of network controllability (2018)
- BMC Bioinformatics
Kanhaiya Krishna, Rogojin Vladimir, Kazemi Keivan, Czeizler Eugen, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Structural target controlability of linear networks (2018)
- IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
Eugen Czeizler, Cristian Gratie, Wu Kai Chiu, Krishna Kanhaiya, Ion Petre
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Systems Biology Analysis Identifies Targetable Vulnerability Networks to Proteasome Inhibitors in Multiple Myeloma (2018)
- Blood
Meads Mark B., Renatino Canevarolo Rafael, Sudalagunta Praneeth Reddy, Oliveira Paula S., Magaletti Dario M., Fang Bin, Silva Maria D Coelho Siqueira, Kulkarni Amit, Dai Hongyue, Dalton William S., Petre Ion, Koomen John M., Silva Ariosto Siqueira and Shain Kenneth H.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
WEBRSIM: A web-based reaction systems simulator (2018) Enjoying Natural Computing Ivanov Sergiu, Rogojin Vladimir, Azimi Sepinoud, Petre Ion
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
A Foundational Framework for Step-by-step Model Construction (2017)
- Fundamenta Informaticae
Barash Mikhail, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Magician in Science. Liber Amicorum Grzegorz Rozenberg (2017) Azimi Sepinoud, Hoogeboom Hendrik Jan, Kleijn Jetty, van der NatMarloes , Petre Ion, Salomaa Arto
(C2 Toimitustyö tieteelliselle kokoomateokselle)
At the Intersection of Computer Science with Biology, Chemistry and Physics – In Memory of Solomon Marcus (2017)
- Theoretical Computer Science
Paun Gheorghe, Petre Ion, Rozenberg Grzegorz, Salomaa Arto
(C2 Toimitustyö tieteelliselle kokoomateokselle)
Controlling Directed Protein Interaction Networks in Cancer (2017)
- Scientific Reports
Kanhaiya Krishna, Czeizler Eugen, Gratie Cristian, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Multi-Stability, Limit Cycles, and Period-Doubling Bifurcation with Reaction Systems (2017)
- International Journal of Foundations of Computer Science
Azimi Sepinoud, Panchal Charmi, Mizera Andrzej, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Reaction systems: a model of computation inspired by the functioning of the living cell (2017) The Role of Theory in Computer Science Ehrenfeucht Andrzej, Petre Ion, Rozenberg Grzegorz
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Stepwise construction of a metabolic network in Event-B: the heat shock response (2017)
- Computers in Biology and Medicine
Sanwal Usman, Petre Luigia, Petre Ion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Tailored approaches in drug development and diagnostics - from molecular design to biological model systems (2017)
- Advanced Healthcare Materials
Sahlgren Cecilia; Meinander Annika; Zhang Hongbo; Cheng Fang; Preis Maren; Xu Chunlin; Salminen Tiina; Toivola Diana; Abankwa Daniel; Karaman Didem; Salo Outi; Österbacka Ronald; Eriksson John E; Willför Stefan; Petre Ion; Peltonen Jouko; Leino Reko; Johnson Mark; Rosenholm Jessica; Sandler Niklas
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )