PhD, Adjunct professor Sisko Tauriainen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Sisko Tauriainen
PhD, Adjunct professor

- yliopistonlehtori,
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

sisko.tauriainen@utu.fi

+358 29 450 4554

+358 46 921 4201

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0003-3423-5409

Tutkumusprojektit

Research projects

Asiantuntijuusalueet

Virologia; Parechovirukset; Enterovirukset; Soluviljelyt

Biografia

FM, FT Biokemian alalta
Molekyylibiologian dosentti, opetusala molekyylivirologia

Nykyinen toimi: Yliopistonlehtori
Aikaisemmat työpaikat: Yliopisto-opettaja Turun yliopistolla; Yliopistotutkija ja aikaisemmin tutkijatohtori Tampereen yliopistolla; Tutkijatohtori Wayne State University’ssä, Detroit, Michigan; Tohtorikoulutettava Turun yliopiston biokemian laitoksella.

Suurimmat rahoitukset: Suomen akatemia, Jane ja Aatos Erkon säätiö

Opinnäytetöiden ohjaus: 4 väitöskirjaa ja yli 20 muuta opinnäytettä

Julkaisut: yli 40 vertaisarvioitua alkuperäistutkimusta ja 7 kokooma-artikkelia

Tutkimus

Parechovirukset kuuluvat pikornaviruksiin. Ne ovat pieniä vaipattomia RNA-viruksia, joilla on ikosahedraalinen rakenne. Humaani parechovirus tyyppi 1 (HPeV1) on hyvin yleinen lasten infektion aiheuttaja; käytännössä jokainen kohtaa viruksen 3 vuoden ikään mennessä. Oireet ovat yleensä lieviä nuhakuumeita tai vatsaoireita, mutta myös oireettomia infektioita esiintyy. HPeV:t pystyvät aiheuttamaan myös vakavampia tauteja kuten aivokalvontulehdusta, aivokuumetta ja vakavia yleisinfektioita. Yleisimmin nämä vakavat infektiot ovat HPeV3:n aiheuttamia.
Olemme tutkineet parechvirusten epidemiologiaa ja tautiyhteyksiä. Totesimme vakavia HPeV3n aiheuttamia tauteja esiintyvän myös Suomessa, lisäksi havaitsimme HPeV4n aiheuttamia vakavia yleisinfektioita. Keskitymme nyt tutkimaan virusten ominaisuuksia ja selvittää miten HPeV:t infektoivat hermosoluja laboratorio-olosuhteissa. Tutkimme miten muutokset viruksen genomissa vaikuttavat infektiokykyyn, viruksen kasvunopeuteen ja virus-solu-vuorovaikutuksiin.

Opetus

Luennot: Virusten elinkierto, Ripulia aiheuttavat virukset, Pikornavirukset
Pienryhmäopetus (Tapauslähtöinen oppiminen): Vesi- ja ruokavälitteiset virukset
Laboratorioharjoitustyöt: Mikrobien diagnostiikka

Julkaisut

3/3

PCR inhibition in stool samples in relation to age of infants (2009)
- Journal of Clinical Virology
Oikarinen S, Tauriainen S, Viskari H, Simell O, Knip M, Virtanen S, Hyoty H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Analysis of pancreas tissue in a child positive for islet cell antibodies (2008)
- Diabetologia
Oikarinen M, Tauriainen S, Honkanen T, Vuori K, Karhunen P, Vasama-Nolvi C, Oikarinen S, Verbeke C, Blair GE, Rantala I, Ilonen J, Simell O, Knip M, Hyoty H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Detection of enteroviruses in the intestine of type 1 diabetic patients (2008)
- Clinical and Experimental Immunology
Oikarinen M, Tauriainen S, Honkanen T, Oikarinen S, Vuori K, Kaukinen K, Rantala I, Maki M, Hyoty H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Interaction of early cow's milk-based formula exposure and enterovirus infection in infancy in the development of type 1 diabetes-associated autoimmunity (2008)
- Diabetologia
Aarnisalo J, Honkanen H, Makela M, Tauriainen S, Marttila J, Veijola R, Knip M, Simell O, Hermann R, Hyoty H, Vaarala O, Ilonen I
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Temporal relationship between human parechovirus 1 infection and otitis media in young children (2008)
- Journal of Infectious Diseases
Tauriainen S, Oikarinen S, Taimen K, Laranne J, Sipila M, Lonnrot M, Ilonen J, Simell O, Knip M, Hyoty H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Human parechovirus 1 infections in young children - No association with type 1 diabetes (2007)
- Journal of Medical Virology
Tauriainen S, Martiskainen M, Oikarinen S, Lonnrot M, Viskari H, Ilonen J, Simell O, Knip M, Hyoty H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Maternal antibodies in breast milk protect the child from enterovirus infections (2007)
- Pediatrics
Sadeharju K, Knip M, Virtanen SM, Savilahti E, Tauriainen S, Koskela P, Akerblom HK, Hyoty H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Amplifying control RNA for RT-PCR applications by nucleic acid sequence based amplification (NASBA) (2006)
- Journal of Virological Methods
Tauriainen S, Dadu E, Oikarinen M, Oikarinen S, Hyoty H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Molecular analysis of an echovirus 3 strain isolated from an individual concurrently with appearance of islet cell and IA-2 autoantibodies (2006)
- Journal of Clinical Microbiology
Williams CH, Oikarinen S, Tauriainen S, Salminen K, Hyoty H, Stanway G
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Can enteroviruses cause type 1 diabetes? (2003)
- Annals of the New York Academy of Sciences
Tauriainen S, Salminen K, Hyoty H
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
Measurement of firefly luciferase reporter gene activity from cells and lysates using Escherichia coli arsenite and mercury sensors (1999)
- Analytical Biochemistry
Tauriainen S, Virta M, Chang W, Karp M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Luminescent bacterial sensor for cadmium and lead (1998)
- Biosensors and Bioelectronics
Tauriainen S, Karp M, Chang W, Virta M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Recombinant luminescent bacteria for measuring bioavailable arsenite and antimonite (1997)
- Applied and Environmental Microbiology
Tauriainen S, Karp H, Chang W, Virta M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Luminescent biosensors for the detection of metal bioavailability (1996) Virta M, Tauriainen S, Lampinen J, Karp M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )