Sanna Kreula
PhD student
sanmpe@utu.fi Itäinen Pitkäkatu 4 C Turku Työhuone: 6th floor, 6049 |
Bioinformatiikka; Molekyylibiologia; NADPH; E. coli; syanobakteeri
Tutkin ensisijaisesti solun hapetus-pelkistys –reaktioita
prokaryoottisissa mikro-organismeissa ja erityisesti NADPH-metabolian roolia
E.colissa ja fotoautotrofisessa syanobakteerissa Synechocystis sp. PCC
6803:ssa. Nikotiiniamidi-adeniini-dinukleotidifosfaatti (NADP(H)) on keskeinen
elektronin vastaanottaja/luovuttaja, jolla on tärkeä rooli aineenvaihdunnan
anabolisissa reaktioissa, sekä puolustusmekanismissa superoksideja vastaan.
Työn tavoitteena on laajentaa tietämystämme NADP+/ NADP(H)–tasapainoon ja
säätelymekanismeihin liittyvistä tekijöistä, sekä mahdollistaa olemassa olevan
tiedon vertailua eri organismien välillä. Tavoitteena on käyttää erilaisia bioinformatiikan menetelmiä konkreettisena
osana käytännön tukimusta.
2015. Turun Yliopisto. Opetustehtävä
kurssilla Bioinformatics methods workshop: “Cytoscape: analysis, visualization
and data integration of complex, biological networks”.
2012, 2013 ja 2014 Turun Yliopisto, Opetustehtävä
systeemibiologian kurssilla: “Network analysis with
Cytoscape.”
- Patterning of the Autotrophic, Mixotrophic, and Heterotrophic Proteomes of Oxygen-Evolving Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 (2022)
- Frontiers in Microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Finding novel relationships with integrated gene-gene association network analysis of Synechocystis sp. PCC 6803 using species-independent text-mining (2018)
- PeerJ
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Pyridine nucleotide transhydrogenase PntAB is essential for optimal growth and photosynthetic integrity under low-light mixotrophic conditions in Synechocystis sp. PCC 6803 (2017)
- New Phytologist
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Integrating Large-Scale Text Mining and Co-Expression Networks: Targeting NADP(H) Metabolism in E. coli with Event Extraction (2012) Third Workshop on Building and Evaluating Resources for Biomedical Text Mining (BioTxtM 2012) Suwisa Kaewphan, Sanna Kreula, Sofie Van Landeghem, Yves Van de Peer, Patrik R Jones, Filip Ginter
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa)
