Kotisyntyisen bakteeri- ja virusmeningiitin laboratoriodiagnostiikka vahvistaa taudin infektioetiologian, mahdollistaa bakteeri- ja viruslääkehoidon kohdentamisen niistä hyötyville potilaille ja vähentää tarpeettomaan mikrobilääkehoitoon liittyviä haittoja. Eri aiheuttajien erotteluun käytössä olevat laboratoriodiagnostiset menetelmät voidaan jakaa mikrobiologiseen diagnostiikkaan sekä elimistön tulehdusvastetta kuvaaviin biomerkkiaineisiin. Monianalyyttisten polymeraasiketjureaktioon (PCR) perustuvien testien kliininen käyttö meningiitin rutiinidiagnosoinnissa lisääntyy jatkuvasti. Nyt käytössä olevien bakteeri-infektion merkkiaineiden, kuten C-reaktiivisen proteiinin (CRP) ja prokalsitoniinin rinnalle diagnostiikkaan on tulossa muita merkkiaineita ja merkkiaineiden yhdistelmiä. Tutkimusnäyttö uusien diagnostisten testien vaikutuksesta kliiniseen päätöksentekoon on puutteellista.