Merkittävälle osalle vastasyntyneistä tehdään diagnostisia toimenpiteitä tai hoitotoimenpiteitä sepsisepäilyn takia. Koska tauti alkaa epäspesifisin oirein, on hengenvaarallinen ja etenee

nopeasti, sepsiksen epäilyn kynnyksen on oltava matala. Epäilyn syntyessä diagnostisten tutkimusten tuloksia tulee odottaa mikrobilääkesuojassa. Epäilyn väistyessä mikrobilääkehoito

lopetetaan viivyttelemättä. Mikrobilääkityksen tulee kattaa tavallisimmat sepsiksen aiheuttajat,

mutta hyvään käyttöön kuuluu turhan laajakirjoisten lääkkeiden välttäminen. Tulevaisuuden

haasteena on löytää herkkä diagnostinen testi, joka löytää hoitoa vaativat vastasyntyneet jo oireiden alussa ja jonka avulla voidaan luotettavasti sulkea pois sepsis turhien mikrobilääkekuurien ja hoitopäivien sekä lapsen ja äidin erottamisen välttämiseksi.