Silva Uusi-Heikkilä
PhD in Evolutionary Ecology. Docent in Evolutionary Biology
silva.uusi-heikkila@utu.fi Natura, yliopistonmäki Turku ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-6503-455X |
Asiantuntijuusalueet
Evoluutiobiologia; Kokeellinen tutkimus; Molekyylibiologia; Uuden sukupolven sekvensointimenetelmät; Genomiikka; Mikrobiomit.
Evoluutiobiologia; Kokeellinen tutkimus; Molekyylibiologia; Uuden sukupolven sekvensointimenetelmät; Genomiikka; Mikrobiomit.
Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe
Hevosen suolistomikrobisto ja suolistotulehduksen (IBD) aiheuttamat molekyylitason muutokset suolistossa: FINEBIOME (Finnish eDNA/equine microbiome). Kalastusevoluutio ja adaptiivinen potentiaali.
Hevosen suolistomikrobisto ja suolistotulehduksen (IBD) aiheuttamat molekyylitason muutokset suolistossa: FINEBIOME (Finnish eDNA/equine microbiome). Kalastusevoluutio ja adaptiivinen potentiaali.
Tutkimus
Parhaillaan tutkin kroonista suolistotulehdusta (IBD) ja sen vaikutusta hevosen suolistomikrobistoon sekä suoliston mitokondrioiden toimintaan.
Tutkin myös kokeellisesti ihmisen aiheuttamien ympäristömuutosten vaikutusta kalapopulaatioihin. Pääasiallisesti tutkin kokoon kohdistuvan kalastuksen vaikutuksia ja viime vuosina olemme tutkimusryhmässäni altistaneet kalapopulaatioita muille samanaikaisille stressitekijöille kuten lämpötilan muutoksille, nälkiintymiselle, saasteille ja tulehduksille. Tutkimme näiden tekijöiden vaikutuksia sekä kalojen ilmiasuun että perimään (koko genomin sekvensointi, bisulfaattisekvensointi, RNA-sekvensointi). Tutkimme myös miten lämpötilastressi, hypoksia ja genotyyppi vaikuttavat kalojen ihon mikrobiston koostumukseeen.
Olen myös tehnyt yhteisöekologiatutkimusta mallintamalla akvaattisia ravintoverkkoja ja muutoksia niiden dynamiikassa.
Opetus
Julkaisut 
2/3
- Size does matter — the eco-evolutionary effects of changing body size in fish (2020)
- Environmental Reviews
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Association Mapping Based on a Common-Garden Migration Experiment Reveals Candidate Genes for Migration Tendency in Brown Trout (2019)
- G3: genes, genomes, genetics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Comparing RADseq and microsatellites for estimating genetic diversity and relatedness Implications for brown trout conservation (2019)
- Ecology and Evolution
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Experimental Size‐Selective Harvesting Affects Behavioral Types of a Social Fish (2019)
- Transactions of the American Fisheries Society
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Size‐selective harvesting fosters adaptations in mating behaviour and reproductive allocation, affecting sexual selection in fish (2019)
- Journal of Animal Ecology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Size-selective harvesting fosters adaptations in mating behaviour and reproductive allocation, affecting sexual selection in fish (2019)
- Journal of Animal Ecology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Comparison of Migratory and Resident Populations of Brown Trout Reveals Candidate Genes for Migration Tendency (2018)
- Genome Biology and Evolution
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Genome-wide divergence patterns support fine-scaled genetic structuring associated with migration tendency in brown trout (2018)
- Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Relatively large males lower reproductive success in female zebrafish (2018)
- Environmental Biology of Fishes
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Species’ ecological functionality alters the outcome of fish stocking success predicted by a food-web model (2018)
- Royal Society Open Science
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Sustainability of Fishing Is about Abundance: A Response to Bernatchez et al. (2018)
- Trends in Ecology and Evolution
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Rapid, broad-scale gene expression evolution in experimentally harvested fish populations (2017)
- Molecular Ecology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Altered trait variability in response to size-selective mortality (2016)
- Biology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Body length rather than routine metabolic rate and body condition correlates with activity and risk-taking in juvenile zebrafish Danio rerio (2016)
- Journal of Fish Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Isoja emokaloja tarvitaan (2015)
- Suomen Kalastuslehti
(D1 Artikkeli ammattilehdessä) - Isojen kalojen pyytäminen heikentää kalakantoja (2015)
- Helsingin Sanomat
(E1 Yleistajuinen artikkeli lehdessä) - The evolutionary legacy of size-selective harvesting extends from genes to populations (2015)
- Evolutionary Applications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Turbidity affects social dynamics in Trinidadian guppies (2015)
- Behavioral Ecology and Sociobiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Evolutionary impact assessment: accounting for evolutionary consequences of fishing in an ecosystem approach to fisheries management (2014)
- Fish and Fisheries
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Can fisheries-induced evolution shift reference points for fisheries management? (2013)
- ICES Journal of Marine Science
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Turun yliopiston Tutkimustietojärjestelmän portaali