PhD in Evolutionary Ecology. Docent in Evolutionary Biology Silva Uusi-Heikkilä - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Silva Uusi-Heikkilä
PhD in Evolutionary Ecology. Docent in Evolutionary Biology

- dosentti
biologian laitosfysiologia ja genetiikka (matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta) (biologian laitos)
- yliopisto-opettaja

silva.uusi-heikkila@utu.fi

Natura, yliopistonmäki

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-6503-455X

Asiantuntijuusalueet

Evoluutiobiologia; Kokeellinen tutkimus; Molekyylibiologia; Uuden sukupolven sekvensointimenetelmät; Genomiikka; Mikrobiomit.

Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe

Hevosen suolistomikrobisto ja suolistotulehduksen (IBD) aiheuttamat molekyylitason muutokset suolistossa: FINEBIOME (Finnish eDNA/equine microbiome). Kalastusevoluutio ja adaptiivinen potentiaali.

Tutkimus

Parhaillaan tutkin kroonista suolistotulehdusta (IBD) ja sen vaikutusta hevosen suolistomikrobistoon sekä suoliston mitokondrioiden toimintaan.

Tutkin myös kokeellisesti ihmisen aiheuttamien ympäristömuutosten vaikutusta kalapopulaatioihin. Pääasiallisesti tutkin kokoon kohdistuvan kalastuksen vaikutuksia ja viime vuosina olemme tutkimusryhmässäni altistaneet kalapopulaatioita muille samanaikaisille stressitekijöille kuten lämpötilan muutoksille, nälkiintymiselle, saasteille ja tulehduksille. Tutkimme näiden tekijöiden vaikutuksia sekä kalojen ilmiasuun että perimään (koko genomin sekvensointi, bisulfaattisekvensointi, RNA-sekvensointi). Tutkimme myös miten lämpötilastressi, hypoksia ja genotyyppi vaikuttavat kalojen ihon mikrobiston koostumukseeen.

Olen myös tehnyt yhteisöekologiatutkimusta mallintamalla akvaattisia ravintoverkkoja ja muutoksia niiden dynamiikassa.

Opetus

Julkaisut

2/3

Implications of size‐selective fisheries on sexual selection (2020)
- Evolutionary Applications
Uusi‐Heikkilä Silva
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2020)
- Environmental Reviews
Ahti Pauliina A.; Kuparinen Anna; Uusi-Heikkilä Silva
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
2019
- G3: genes, genomes, genetics
Lemopoulos A, Uusi-Heikkilä S, Hyvärinen P, Alioravainen N, Prokkola JM, Elvidge CK, Vasemägi A, Vainikka A
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Sustainability of Fishing Is about Abundance: A Response to Bernatchez et al. (2019)
- Ecology and EvolutionJournal of Animal Ecology
Lemopoulos A., Prokkola J.M., Uusi-Heikkilä S., Vasemägi A., Huusko A., Hyvärinen P., Koljonen M.-L., Koskiniemi J., Vainikka A.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2019)
- Transactions of the American Fisheries Society
Sbragaglia Valerio; Alós Josep; Fromm Kim; Monk Christopher T.; Díaz‐Gil Carlos; Uusi‐Heikkilä Silva; Honsey Andrew E.; Wilson Alexander D. M.; Arlinghaus Robert
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Size‐selective harvesting fosters adaptations in mating behaviour and reproductive allocation, affecting sexual selection in fish (2019)
Sbragaglia Valerio; Gliese Catalina; Bierbach David; Honsey Andrew E.; Uusi‐Heikkilä Silva; Arlinghaus Robert
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2019)
- Journal of Animal EcologyJournal of Fish BiologyEvolutionary Applications
Valerio Sbragaglia, Catalina Gliese, David Bierbach, Andrew E. Honsey, Silva Uusi‐Heikkilä, Robert Arlinghau
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Comparison of Migratory and Resident Populations of Brown Trout Reveals Candidate Genes for Migration Tendency (2018)
- Genome Biology and EvolutionBehavioral Ecology and Sociobiology
Lemopoulos A, Uusi-Heikkilä S, Huusko A, Vasemägi A, Vainikka A
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Genome-wide divergence patterns support fine-scaled genetic structuring associated with migration tendency in brown troutAltered trait variability in response to size-selective mortalityIsojen kalojen pyytäminen heikentää kalakantoja (2018)
- Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
Lemopoulos A, Uusi-Heikkila S, Vasemagi A, Huusko A, Kokko H, Vainikka AA1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä
Relatively large males lower reproductive success in female zebrafishBody length rather than routine metabolic rate and body condition correlates with activity and risk-taking in juvenile zebrafish Danio rerioThe evolutionary legacy of size-selective harvesting extends from genes to populations (2018)
- Environmental Biology of Fishes
Uusi-Heikkilä S., Bierbach D., Alós J., Tscheligi P., Wolter C., Arlinghaus R.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Species’ ecological functionality alters the outcome of fish stocking success predicted by a food-web model (2018)
- Royal Society Open Science
Uusi-Heikkilä Silva; Perälä Tommi; Kuparinen Anna
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2018)
- Trends in Ecology and Evolution
Kuparinen Anna; Uusi-Heikkilä Silva
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Rapid, broad-scale gene expression evolution in experimentally harvested fish populations (2017)
- Molecular EcologySuomen Kalastuslehti
Silva Uusi-Heikkilä, Tiina Sävilammi, Erica Leder, Robert Arlinghaus, Craig R. Primmer
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2016)
- Biology LettersHelsingin Sanomat
Uusi-Heikkila S, Lindstrom K, Parre N, Arlinghaus R, Alos J, Kuparinen A
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2016)
Polverino G, Bierbach D, Killen SS, Uusi-Heikkila S, Arlinghaus R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Isoja emokaloja tarvitaan (2015)
Anna Kristiina Kuparinen, Silva Uusi-Heikkilä, Anssi Vainikka
(D1 Artikkeli ammattilehdessä)
(2015)
Silva Uusi-Heikkilä, Anna Kuparinen
(E1 Yleistajuinen artikkeli lehdessä)
(2015)
Silva Uusi-Heikkilä, Andrew R. Whiteley, Anna Kuparinen, Shuichi Matsumura, Paul A. Venturelli, Christian Wolter, Jon Slate, Craig R. Primmer, Thomas Meinelt, Shaun S. Killen, David Bierbach, Giovanni Polverino, Arne Ludwig, Robert Arlinghaus
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Turbidity affects social dynamics in Trinidadian guppies (2015)
Karoline K. Borner, Stefan Krause, Thomas Mehner, Silva Uusi-Heikkilä, Indar W. Ramnarine, Jens Krause
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Evolutionary impact assessment: accounting for evolutionary consequences of fishing in an ecosystem approach to fisheries management (2014)
- Fish and Fisheries
Ane T Laugen, Georg H Engelhard, Rebecca Whitlock, Robert Arlinghaus, Dorothy J Dankel, Erin S Dunlop, Anne M Eikeset, Katja Enberg, Christian Jørgensen, Shuichi Matsumura, Sébastien Nusslé, Davnah Urbach, Loїc Baulier, David S Boukal, Bruno Ernande, Fiona D Johnston, Fabian Mollet, Heidi Pardoe, Nina O Therkildsen, Silva Uusi-Heikkilä, Anssi Vainikka, Mikko Heino, Adriaan D Rijnsdorp, Ulf Dieckmann
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )