Ph.D; Docent Zhi Chen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Zhi Chen
Ph.D; Docent

- dosentti,
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

zchen@utu.fi

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-4658-7463

Asiantuntijuusalueet

T cells; inflammation; autoimmune

Julkaisut

(2020)
- iScienceBMC Systems Biology
Mohd Moin Khan, Ubaid Ullah, Meraj H. Khan, Lingjia Kong, Robert Moulder, Tommi Välikangas, Santosh Dilip Bhosale, Elina Komsi, Omid Rasool, Zhi Chen, Laura L. Elo, Jukka Westermarck, Riitta Lahesmaa
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2019)
- Frontiers in immunologyBioinformatics
Satyajeet P. Khare, Ankitha Shetty, Rahul Biradar, Indumathi Patta, Zhi Jane Chen, Ameya V. Sathe, Puli Chandramouli Reddy, Riitta Lahesmaa, Sanjeev Galande
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Estrogen receptor alpha contributes to T cell-mediated autoimmune inflammation by promoting T cell activation and proliferation (2018)
- Science SignalingAntioxidants and Redox Signaling
Mohammad I, Starskaia I, Nagy T, Guo JT, Yatkin E, Väänänen K, Watford WT, Chen Z
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2018)
- PLoS BiologyBlood
Imran Mohammad, Kari Nousiainen, Santosh D. Bhosale, Inna Starskaia, Robert Moulder, Anne Rokka, Fang Cheng, Ponnuswamy Mohanasundaram, John E. Eriksson, David R. Goodlett, Harri Lähdesmäki, Zhi Chen
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
AMIGO2 modulates T cell functions and its deficiency in mice ameliorates experimental autoimmune encephalomyelitis (2017)
- Brain, Behavior, and Immunity
Zhilin Li, Mohd Moin Khan, Juha Kuja-Panula, Hongyun Wang, Yu Chen, Deyin Guo, Zhi Jane Chen, Riitta Lahesmaa, Heikki Rauvala, Li Tian,
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Genome-wide Analysis of STAT3-Mediated Transcription during Early Human Th17 Cell Differentiation2017
- Cell Reports
Tripathi Subhash K, Chen Zhi, Larjo Antti, Kanduri Kartiek, Nousiainen Kari, Aijo Tarmo, Ricano-Ponce Isis, Hrdlickova Barbara, Tuomela Soile, Laajala Essi, Salo Verna, Kumar Vinod, Wijmenga Cisca, Lahdesmaki Harri, Lahesmaa Riitta
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
CIP2A Promotes T-Cell Activation and Immune Response to Listeria monocytogenes Infection (2016)
- PLoS ONE
Côme C, Cvrljevic A, Khan MM, Treise I, Adler T, Aguilar-Pimentel JA, Au-Yeung B, Sittig E, Laajala TD, Chen Y, Oeder S, Calzada-Wack J, Horsch M, Aittokallio T, Busch DH, Ollert MW, Neff F, Beckers J, Gailus-Durner V, Fuchs H, Hrabě de Angelis M, Chen Z, Lahesmaa R, Westermarck J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Comparative analysis of human and mouse transcriptomes of Th17 cell priming (2016)
- Oncotarget
Soile Tuomela, Sini Rautio, Helena Ahlfors, Viveka Öling, Verna Salo,
Ubaid Ullah, Zhi Chen, Saara Hämälistö, Subhash K. Tripathi, Tarmo Äijö,
Omid Rasool, Hayssam Soueidan, Lodewyk Wessels, Brigitta Stockinger,
Harri Lähdesmäki, Riitta Lahesmaa
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Analyzing Th17 cell differentiation dynamics using a novel integrative modeling framework for time-course RNA sequencing data (2015)
Intosalmi J, Ahlfors H, Rautio S, Mannerstom H, Chen ZJ, Lahesmaa R, Stockinger B, Lahdesmaki H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Methods for time series analysis of RNA-seq data with application to human Th17 cell differentiation (2014)
Äijö Tarmo, Butty Vincent, Chen Zhi, Salo Verna, Tripathi Subhash, Burge Christopher B, Lahesmaa Riitta, Lähdesmäki Harri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Quantitative proteomics analysis of signalosome dynamics in primary T cells identifies the surface receptor CD6 as a Lat adaptor-independent TCR signaling hub (2014)
- Nature Immunology
Roncagalli R, Hauri S, Fiore F, Liang Y, Chen Z, Sansoni A, Kanduri K, Joly R, Malzac A, Lähdesmäki H, Lahesmaa R, Yamasaki S, Saito T, Malissen M, Aebersold R, Gstaiger M, Malissen B
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Reactive Oxygen Species Deficiency Induces Autoimmunity with Type 1 Interferon Signature (2014)
Kelkka Tiina, Kienhöfer Deborah, Hoffmann Markus, Linja Marjo, Wing Kajsa, Sareila Outi, Hultqvist Malin, Laajala Essi, Chen Zhi, Vasconcelos Julia, Neves Esmeralda, Guedes Margarida, Marques Laura, Krönke Gerhard, Helminen Merja, Kainulainen Leena, Olofsson Peter, JalkanenSirpa, Lahesmaa Riitta, Souto-Carneiro M. Margarida, Holmdahl Rikard
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
From a gene-centric to whole-proteome view of differentiation of T helper cell subsets (2013)
- Briefings in Functional Genomics
Lonnberg T, Chen Z, Lahesmaa R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Identification of early gene expression changes during human Th17 cell differentiation (2012)
Tuomela Soile, Salo Verna, Tripathi Subhash K, Chen Zhi, Laurila Kirsti, Gupta Bhawna, Äijö Tarmo, Oikari Lotta, Stockinger Brigitta, Lähdesmäki Harri, Lahesmaa Riitta
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Early target genes of IL-12 and STAT4 signaling in th cells. (2004)
- Journal of Immunology
Lund RJ, Chen Z, Scheinin J, Lahesmaa R.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Identification of novel IL-4/Stat6-regulated genes in T lymphocytes. (2003)
- Journal of Immunology
Chen Z, Lund R, Aittokallio T, Kosonen M, Nevalainen O, Lahesmaa R.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )