Pedro Puigbo - UTU Research Portal

Pedro Puigbo

- dosentti,
biologian laitos (matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta)

pepuav@utu.fi

Personal Web site

Google Scholar

Asiantuntijuusalueet

Evolutionary Genomics, Microbial Genomics, Evolution, Phylogenomics, Computational Biology, Bioinformatics

Julkaisut

2/2

A Pilot Study for Metabolic Profiling of Obesity-Associated Microbial Gut Dysbiosis in Male Wistar RatsInevitability of Genetic Parasites (2021)
- BiomoleculesJournal of Computational Biology
Hernandez-Baixauli Julia, Puigbo Pere, Torrell Helena, Palacios-Jordan Hector, Ripoll Vicent J. Ribas, Caimari Antoni, Del Bas Josep M., Baselga-Escudero Laura, Mulero Miquel
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2021)
- Journal of Hazardous MaterialsProceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
Leino Lyydia, Tall Tuomas, Helander Marjo, Saloniemi Irma, Saikkonen Kari, Ruuskanen Suvi, Puigbò Pere
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Genomics of the Proteorhodopsin-Containing Marine Flavobacterium Dokdonia sp Strain MED1342019Evolutionary Genomics: Statistical and Computational Methods Puigbò Pere, Wolf Yuri I., Koonin Eugene V.
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Six-week endurance exercise alters gut metagenome that is not reflected in systemic metabolism in over-weight womenGlycosylation Focuses Sequence Variation in the Influenza A Virus H1 Hemagglutinin Globular Domain (2018)
- Frontiers in microbiology
Eveliina Munukka, Juha P. Ahtiainen, Pere Puigbó, Sirpa Jalkanen, Katja Pahkala, Anniina Keskitalo, Urho M. Kujala, Sami Pietilä, Maija Hollmén, Laura Elo, Pentti Huovinen, Giuseppe D'Auria, Satu Pekkala
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Reconstruction of the evolution of microbial defense systemsPhylogenomics of Prokaryotic Ribosomal Proteins2017
- BMC Evolutionary Biology
Puigbò, Makarova, Kristensen, Wolf, Koonin
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2016)
- Genome Biology and Evolution
Iranzo J, Puigbo P, Lobkovsky AE, Wolf YI, Koonin EV
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A comprehensive census of horizontal gene transfers from prokaryotes to unikonts (2014)
- BMC Biology
Puigbo P, Lobkovsky AE, Kristensen DM, Wolf YI, Koonin EV
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2013)
- BMC Biology
Puigbo P, Wolf YI, Koonin EV
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Genome-wide comparative analysis of phylogenetic trees: the prokaryotic forest of life (2012)
- Methods in Molecular BiologyEnvironmental Microbiology
Evolutionary Genomics : Statistical and Computational Methods, Volume 2 Puigbò P., Wolf Y.I., Koonin E.V.
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Genomic determinants of sporulation in Bacilli and Clostridia: towards the minimal set of sporulation-specific genes (2012)
Galperin MY, Mekhedov SL, Puigbo P, Smirnov S, Wolf YI, Rigden DJ
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
(2012)
- PLoS ONEApplied and Environmental Microbiology
Yutin N, Puigbo P, Koonin EV, Wolf YI
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2011)
- Genome BiologyPLoS Pathogens
Puigbo P, Mekhedov S, Wolf YI, Koonin EV
(O2 Muu julkaisu )
Comparison of phylogenetic trees and search for a central trend in the "forest of life" (2011)
Koonin EV, Puigbò P, Wolf YI
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Fitness costs limit influenza A virus hemagglutinin glycosylation as an immune evasion strategy (2011)
Das SR, Hensley SE, David A, Schmidt L, Gibbs JS, Puigbo P, Ince WL, Bennink JR, Yewdell JW
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2011)
Gonzalez JM, Pinhassi J, Fernandez-Gomez B, Coll-Llado M, Gonzalez-Velazquez M, Puigbo P, Jaenicke S, Gomez-Consarnau L, Fernandez-Guerra A, Goesmann A, Pedros-Alio C
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2010)
Das SR, Puigbo P, Hensley SE, Hurt DE, Bennink JR, Yewdell JW
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )