Pedro Puigbo - UTU Tutkimustietojärjestelmä - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Pedro Puigbo

- dosentti,
biologian laitos (matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta)

pepuav@utu.fi

Personal Web site

Google Scholar

Asiantuntijuusalueet

Evolutionary Genomics, Microbial Genomics, Evolution, Phylogenomics, Computational Biology, Bioinformatics

Julkaisut

2/2

A Pilot Study for Metabolic Profiling of Obesity-Associated Microbial Gut Dysbiosis in Male Wistar Rats (2021)
- Biomolecules
Hernandez-Baixauli Julia, Puigbo Pere, Torrell Helena, Palacios-Jordan Hector, Ripoll Vicent J. Ribas, Caimari Antoni, Del Bas Josep M., Baselga-Escudero Laura, Mulero Miquel
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Classification of the glyphosate target enzyme (5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase) for assessing sensitivity of organisms to the herbicideGenomic determinants of sporulation in Bacilli and Clostridia: towards the minimal set of sporulation-specific genes (2021)
- Journal of Hazardous MaterialsEnvironmental Microbiology
Leino Lyydia, Tall Tuomas, Helander Marjo, Saloniemi Irma, Saikkonen Kari, Ruuskanen Suvi, Puigbò Pere
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Genome-Wide Comparative Analysis of Phylogenetic Trees: The Prokaryotic Forest of LifePhylogenomics of Prokaryotic Ribosomal Proteins (2019) Evolutionary Genomics: Statistical and Computational Methods Puigbò Pere, Wolf Yuri I., Koonin Eugene V.
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Six-week endurance exercise alters gut metagenome that is not reflected in systemic metabolism in over-weight womenA comprehensive census of horizontal gene transfers from prokaryotes to unikonts (2018)
- Frontiers in microbiologyGenome Biology
Eveliina Munukka, Juha P. Ahtiainen, Pere Puigbó, Sirpa Jalkanen, Katja Pahkala, Anniina Keskitalo, Urho M. Kujala, Sami Pietilä, Maija Hollmén, Laura Elo, Pentti Huovinen, Giuseppe D'Auria, Satu Pekkala
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Reconstruction of the evolution of microbial defense systems (2017)
- BMC Evolutionary BiologyJournal of Computational Biology
Puigbò, Makarova, Kristensen, Wolf, Koonin
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Inevitability of Genetic ParasitesFitness costs limit influenza A virus hemagglutinin glycosylation as an immune evasion strategy (2016)
- Genome Biology and EvolutionProceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
Iranzo J, Puigbo P, Lobkovsky AE, Wolf YI, Koonin EV
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Genomes in turmoil: quantification of genome dynamics in prokaryote supergenomesGenomics of the Proteorhodopsin-Containing Marine Flavobacterium Dokdonia sp Strain MED134 (2014)
- BMC BiologyApplied and Environmental Microbiology
Puigbo P, Lobkovsky AE, Kristensen DM, Wolf YI, Koonin EV
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Seeing the Tree of Life behind the phylogenetic forest (2013)
- BMC BiologyPLoS Pathogens
Puigbo P, Wolf YI, Koonin EV
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Genome-wide comparative analysis of phylogenetic trees: the prokaryotic forest of life (2012)
- Methods in Molecular Biology
Evolutionary Genomics : Statistical and Computational Methods, Volume 2 Puigbò P., Wolf Y.I., Koonin E.V.
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
2012
Galperin MY, Mekhedov SL, Puigbo P, Smirnov S, Wolf YI, Rigden DJA2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä
(2012)
- PLoS ONE
Yutin N, Puigbo P, Koonin EV, Wolf YI
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2011)
Puigbo P, Mekhedov S, Wolf YI, Koonin EV
(O2 Muu julkaisu )
Comparison of phylogenetic trees and search for a central trend in the "forest of life" (2011)
Koonin EV, Puigbò P, Wolf YI
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2011)
Das SR, Hensley SE, David A, Schmidt L, Gibbs JS, Puigbo P, Ince WL, Bennink JR, Yewdell JW
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2011)
Gonzalez JM, Pinhassi J, Fernandez-Gomez B, Coll-Llado M, Gonzalez-Velazquez M, Puigbo P, Jaenicke S, Gomez-Consarnau L, Fernandez-Guerra A, Goesmann A, Pedros-Alio C
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Glycosylation Focuses Sequence Variation in the Influenza A Virus H1 Hemagglutinin Globular Domain (2010)
Das SR, Puigbo P, Hensley SE, Hurt DE, Bennink JR, Yewdell JWA1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä