Pekka Ruusuvuori - UTU Tutkimustietojärjestelmä - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Pekka Ruusuvuori

- ,
InFLAMES Lippulaiva (lääketieteellinen tiedekunta)
- apulaisprofessori, II vaihe,
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

pekka.ruusuvuori@utu.fi

+358 29 450 2132

+358 50 472 1830

Kiinamyllynkatu 10

Turku

Julkaisut

2/3

(2023)
- PLoS ONE
Petäinen Liisa, Väyrynen Juha P., Ruusuvuori Pekka, Pölönen Ilkka, Äyrämö Sami, Kuopio Teijo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2023)
- Acta Neuropathologica CommunicationsNature Communications
Rautajoki Kirsi, Jaatinen Serafiina, Hartewig Anja, Tiihonen Aliisa, Annala Matti, Salonen Iida, Valkonen Masi, Simola Vili, Vuorinen Elisa M., Kivinen Anni, Rauhala Minna, Nurminen Riikka, Maass Kendra, Lahtela Sirpa-Liisa, Jukkola Arja, Yli-Harja Olli, Helen Pauli, Pajtler Kristian, Ruusuvuori Pekka, Haapasalo Joonas, Zhang Wei, Haapasalo Hannu, Nykter Matti
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Improved accuracy in colorectal cancer tissue decomposition through refinement of established deep learning solutionsH&E Multi-Laboratory Staining Variance Exploration with Machine Learning2023
- Scientific ReportsApplied Sciences
Prezja Fabi, Äyrämö Sami, Pölönen Ilkka, Ojala Timo, Lahtinen Suvi, Ruusuvuori Pekka, Kuopio Teijo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2023)
- HistopathologyOncogenesis
Egevad Lars, Delahunt Brett, Iczkowski Kenneth A, van der Kwast Theo, van Leenders Geert JLH, Leite Katia RM, Pan Chin-Chen, Samaratunga Hemamali, Tsuzuki Toyonori, Mulliqi Nita, Ji Xiaoyi, Olsson Henrik, Valkonen Masi, Ruusuvuori Pekka, Eklund Martin, Kartasalo Kimmo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
STAGETOOL, a Novel Automated Approach for Mouse Testis Histological Analysis (2023)
- Endocrinology
Meikar Oliver, Majoral Daniel, Heikkinen Olli, Valkama Eero, Leskinen Sini, Rebane Ana, Ruusuvuori Pekka, Toppari Jorma, Mäkelä Juho-Antti, Kotaja Noora
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The effect of neural network architecture on virtual H&E staining: Systematic assessment of histological feasibility (2023)
- PatternsEuropean Urology Focus
Khan Umair, Koivukoski Sonja, Valkonen Mira, Latonen Leena, Ruusuvuori Pekka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Unstained Tissue Imaging and Virtual Hematoxylin and Eosin Staining of Histologic Whole Slide Images (2023)
- Laboratory InvestigationEuropean Journal of Cancer
Koivukoski Sonja, Khan Umair, Ruusuvuori Pekka, Latonen Leena
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Artificial intelligence for diagnosis and Gleason grading of prostate cancer: the PANDA challengeConvolutional Neural Network-Based Artificial Intelligence for Classification of Protein Localization Patterns (2022)
- Nature MedicineBiomolecules
Bulten Wouter, Kartasalo Kimmo, Chen Po-Hsuan Cameron, Ström Peter, Pinckaers Hans, Nagpal Kunal, Cai Yuannan, Steiner David F., van Boven Hester, Vink Robert, Hulsbergen-van de Kaa Christina, van der Laak Jeroen, Amin Mahul B., Evans Andrew J., van der Kwast Theodorus, Allan Robert, Humphrey Peter A., Grönberg Henrik, Samaratunga Hemamali, Delahunt Brett, Tsuzuki Toyonori, Häkkinen Tomi, Egevad Lars, Demkin Maggie, Dane Sohier, Tan Fraser, Valkonen Masi, Corrado Greg S., Peng Lily, Mermel Craig H., Ruusuvuori Pekka, Litjens Geert, Eklund Martin, the PANDA challenge consortium
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Detection of perineural invasion in prostate needle biopsies with deep neural networksGeneralized fixation invariant nuclei detection through domain adaptation based deep learning (2022)
- Virchows ArchivIEEE Journal of Biomedical and Health Informatics
Kartasalo Kimmo, Ström Peter, Ruusuvuori Pekka, Samaratunga Hemamali, Delahunt Brett, Tsuzuki Toyonori, Eklund Martin, Egevad Lars
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Estimating diagnostic uncertainty in artificial intelligence assisted pathology using conformal prediction (2022)
Olsson Henrik, Kartasalo Kimmo, Mulliqi Nita, Capuccini Marco, Ruusuvuori Pekka, Samaratunga Hemamali, Delahunt Brett, Lindskog Cecilia, Janssen Emiel A.M., Blilie Anders, Egevad Lars, Spjuth Ola, Eklund Martin
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2022)
Prezja Fabi, Polonen Ilkka, Ayramo Sami, Ruusuvuori Pekka, Kuopio Teijo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
miR-32 promotes MYC-driven prostate cancer (2022)
Scaravilli Mauro, Koivukoski Sonja, Gillen Andrew, Bouazza Aya, Ruusuvuori Pekka, Visakorpi Tapio, Latonen Leena
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Parametric modeling in biomedical image synthesis (2022) Biomedical Image Synthesis and Simulation: Methods and Applications Ruusuvuori Pekka
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Spatial analysis of histology in 3D: quantification and visualization of organ and tumor level tissue environment (2022)
- Heliyon
Ruusuvuori Pekka, Valkonen Masi, Kartasalo Kimmo, Valkonen Mira, Visakorpi Tapio, Nykter Mira, Latonen Leena
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Artificial Intelligence for Diagnosis and Gleason Grading of Prostate Cancer in Biopsies-Current Status and Next Steps (2021)
Kartasalo Kimmo, Bulten Wouter, Delahunt Brett, Chen Po-Hsuan Cameron, Pinckaers Hans, Olsson Henrik, Ji Xiaoyi, Mulliqi Nita, Samaratunga Hemamali, Tsuzuki Toyonori, Lindberg Johan, Rantalainen Mattias, Wählby Carolina, Litjens Geert, Ruusuvuori Pekka, Egevad Lars, Eklund Martin
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Building a central repository landmarks a new era for artificial intelligence-assisted digital pathology development in Europe (2021)
Latonen Leena, Ruusuvuori Pekka
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
(2021)
Liimatainen Kaisa, Huttunen Riku, Latonen Leena, Ruusuvuori Pekka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2021)
Valkonen Mira, Högnäs Gunilla, Bova G Steven, Ruusuvuori Pekka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Interobserver reproducibility of perineural invasion of prostatic adenocarcinoma in needle biopsies (2021)
- Virchows Archiv
Egevad Lars, Delahunt Brett, Samaratunga Hemamali, Tsuzuki Toyonori, Olsson Henrik, Ström Peter, Lindskog Cecilia, Häkkinen Tomi, Kartasalo Kimmo, Eklund Martin, Ruusuvuori Pekka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
OpenPhi: an interface to access Philips iSyntax whole slide images for computational pathology (2021)
- Bioinformatics
Mulliqi Nita, Kartasalo Kimmo, Olsson Henrik, Ji Xiaoyi, Egevad Lars, Eklund Martin, Ruusuvuori Pekka
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )