Pekka Ruusuvuori - UTU Tutkimustietojärjestelmä - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Pekka Ruusuvuori

- apulaisprofessori,
- apulaisprofessori, II vaihe
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

pekka.ruusuvuori@utu.fi

+358 29 450 2132

+358 50 472 1830

Kiinamyllynkatu 10

Turku

Julkaisut

2/3

STAGETOOL, a Novel Automated Approach for Mouse Testis Histological Analysis (2023)
- EndocrinologyEuropean Urology Focus
Meikar Oliver, Majoral Daniel, Heikkinen Olli, Valkama Eero, Leskinen Sini, Rebane Ana, Ruusuvuori Pekka, Toppari Jorma, Mäkelä Juho-Antti, Kotaja Noora
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The effect of neural network architecture on virtual H&E staining: Systematic assessment of histological feasibility (2023)
- PatternsLaboratory Investigation
Khan Umair, Koivukoski Sonja, Valkonen Mira, Latonen Leena, Ruusuvuori Pekka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Unstained Tissue Imaging and Virtual Hematoxylin and Eosin Staining of Histologic Whole Slide Images (2023)
Koivukoski Sonja, Khan Umair, Ruusuvuori Pekka, Latonen Leena
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Artificial intelligence for diagnosis and Gleason grading of prostate cancer: the PANDA challengeConvolutional Neural Network-Based Artificial Intelligence for Classification of Protein Localization Patterns (2022)
- Nature MedicineBiomolecules
Bulten Wouter, Kartasalo Kimmo, Chen Po-Hsuan Cameron, Ström Peter, Pinckaers Hans, Nagpal Kunal, Cai Yuannan, Steiner David F., van Boven Hester, Vink Robert, Hulsbergen-van de Kaa Christina, van der Laak Jeroen, Amin Mahul B., Evans Andrew J., van der Kwast Theodorus, Allan Robert, Humphrey Peter A., Grönberg Henrik, Samaratunga Hemamali, Delahunt Brett, Tsuzuki Toyonori, Häkkinen Tomi, Egevad Lars, Demkin Maggie, Dane Sohier, Tan Fraser, Valkonen Masi, Corrado Greg S., Peng Lily, Mermel Craig H., Ruusuvuori Pekka, Litjens Geert, Eklund Martin, the PANDA challenge consortium
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Detection of perineural invasion in prostate needle biopsies with deep neural networks (2022)
- Virchows Archiv
Kartasalo Kimmo, Ström Peter, Ruusuvuori Pekka, Samaratunga Hemamali, Delahunt Brett, Tsuzuki Toyonori, Eklund Martin, Egevad Lars
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Estimating diagnostic uncertainty in artificial intelligence assisted pathology using conformal predictionH&E Multi-Laboratory Staining Variance Exploration with Machine LearningGeneralized fixation invariant nuclei detection through domain adaptation based deep learning (2022)
- Nature CommunicationsApplied SciencesIEEE Journal of Biomedical and Health Informatics
Olsson Henrik, Kartasalo Kimmo, Mulliqi Nita, Capuccini Marco, Ruusuvuori Pekka, Samaratunga Hemamali, Delahunt Brett, Lindskog Cecilia, Janssen Emiel A.M., Blilie Anders, Egevad Lars, Spjuth Ola, Eklund Martin
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2022)
Prezja Fabi, Polonen Ilkka, Ayramo Sami, Ruusuvuori Pekka, Kuopio Teijo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
miR-32 promotes MYC-driven prostate cancer (2022)
- OncogenesisBioinformatics
Scaravilli Mauro, Koivukoski Sonja, Gillen Andrew, Bouazza Aya, Ruusuvuori Pekka, Visakorpi Tapio, Latonen Leena
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Parametric modeling in biomedical image synthesisPredicting Molecular Phenotypes from Histopathology Images: A Transcriptome-Wide Expression-Morphology Analysis in Breast Cancer (2022) Biomedical Image Synthesis and Simulation: Methods and Applications Ruusuvuori Pekka
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Spatial analysis of histology in 3D: quantification and visualization of organ and tumor level tissue environment (2022)
- Heliyon
Ruusuvuori Pekka, Valkonen Masi, Kartasalo Kimmo, Valkonen Mira, Visakorpi Tapio, Nykter Mira, Latonen Leena
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Artificial Intelligence for Diagnosis and Gleason Grading of Prostate Cancer in Biopsies-Current Status and Next Steps (2021)
Kartasalo Kimmo, Bulten Wouter, Delahunt Brett, Chen Po-Hsuan Cameron, Pinckaers Hans, Olsson Henrik, Ji Xiaoyi, Mulliqi Nita, Samaratunga Hemamali, Tsuzuki Toyonori, Lindberg Johan, Rantalainen Mattias, Wählby Carolina, Litjens Geert, Ruusuvuori Pekka, Egevad Lars, Eklund Martin
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Building a central repository landmarks a new era for artificial intelligence-assisted digital pathology development in Europe (2021)
- European Journal of Cancer
Latonen Leena, Ruusuvuori Pekka
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
(2021)
Liimatainen Kaisa, Huttunen Riku, Latonen Leena, Ruusuvuori Pekka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2021)
Valkonen Mira, Högnäs Gunilla, Bova G Steven, Ruusuvuori Pekka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2021)
- Virchows Archiv
Egevad Lars, Delahunt Brett, Samaratunga Hemamali, Tsuzuki Toyonori, Olsson Henrik, Ström Peter, Lindskog Cecilia, Häkkinen Tomi, Kartasalo Kimmo, Eklund Martin, Ruusuvuori Pekka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2021)
Mulliqi Nita, Kartasalo Kimmo, Olsson Henrik, Ji Xiaoyi, Egevad Lars, Eklund Martin, Ruusuvuori Pekka
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
(2021)
- Cancer Research
Wang Yinxi, Kartasalo Kimmo, Weitz Philippe, Acs Balazs, Valkonen Masi, Larsson Christer, Ruusuvuori Pekka, Hartman Johan, Rantalainen Mattias
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The emerging role of artificial intelligence in the reporting of prostate pathology (2021)
- PathologyIEEE Transactions on Medical Imaging
Egevad Lars, Delahunt Brett, Samaratunga Hemamali, Tsuzuki Toyonori, Yamamoto Yoichiro, Yaxley John, Ruusuvuori Pekka, Kartasalo Kimmo, Eklund Martin
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
Virtual reality for 3D histology: multi-scale visualization of organs with interactive feature exploration2021
- BMC Cancer
Liimatainen Kaisa, Latonen Leena, Valkonen Masi, Kartasalo Kimmo, Ruusuvuori Pekka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
ANHIR: Automatic Non-Rigid Histological Image Registration Challenge (2020)
Borovec J, Kybic J, Arganda-Carreras I, Sorokin DV, Bueno G, Khvostikov AV, Bakas S, Chang EIC, Heldmann S, Kartasalo K, Latonen L, Lotz J, Noga M, Pati S, Punithakumar K, Ruusuvuori P, Skalski A, Tahmasebi N, Valkonen M, Venet L, Wang YZ, Weiss N, Wodzinski M, Xiang Y, Xu Y, Yan Y, Yushkevich P, Zhao SY, Munoz-Barrutia A, Munoz-Barrutia A
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )