Eva-Mari Aro
Academician of Science
Molecular Plant Biology evaaro@utu.fi +358 29 450 4200 +358 50 430 4639 Tykistökatu 6 Turku Työhuone: 6207 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-2922-1435 |
Fotosynteesin molekyylibiologia, biologinen hiilidioksidin talteenotto, ilmastonmuutos, synteettinen biologia, elävät solutehtaat
Fossiiliset poltto- ja raaka-ainevarat ovat fotosynteesin tuotosta vuosimiljoonien aikana. Niiden massiivinen hyötykäyttö teollistumisen aikakaudella on kuitenkin vapauttanut ilmakehään suunnattomat määrät hiilidioksidia ja pikkuhiljaa aiheuttanut ilmastokriisin, joka hoitamattomana uhkaa tulevaisuuttamme. Fotosynteesitutkijoina etsimme ja sovellamme uusia strategioita fossiilisten raaka- ja polttoaineiden käytön korvaamiseksi kestän kehityksen periaatteella tuotetuilla ratkaisuilla. Avainasemassa on primaarisen energiatuotannon rajallisuus ja keskitymmekin fotosynteesin vahvan perustutkimuksen rinnalla myös tehostamaan kasvien, levien ja syanobakteerien kykyä sitoa auringon energiaa ihmiselle käyttökelpoiseen muotoon ruoaksi, polttoaineiksi ja teollisuuden raaka-aineiksi, päämääränä fossiilisten ratkaisujen alasajo.
Perustutkimuksemme primaarisen energiantuotannon alalla keskittyy fotosynteesiin, johon liittyy tiiviisti myös kasvien stressireaktiot ja geenien säätelyn signalointikaskadit. Tutkimuskohteinamme on lukuisia yhteyttäviä, fotoautotrofisia, organismeja kuten lituruoho (Arabidopsis thaliana), kuusi (Picea abies) ja nuppusammal (Physcomitrella patens), erilaiset yksisoluiset piilevät ja viherlevät sekä syanobakteerit. Perustutkimuksemme selvittää (i) millä tavoin valoenergian nopeaa talteen ottamista ja sitä seuraavaa elekrtoninsiirtoketjua säädellään oksidatiivisen ”valotuhon” estämiseksi, (ii) miten viherhiukkasten valoa keräävät tylakoidikalvostot ovat rakentuneet ja järjestäytyneet, ja miten ne muovautuvat dynaamisesti vastaamaan valo-olosuhteiden muutoksia, ja (iii) kuinka fotosynteesikoneistosta liikkeelle lähtevät signaalit välittyvät tuman genomille ja aikaansaavat muutoksia fotosynteesikoneistossa, sopeuttaen koko eliön toiminnan muuttuviin ympäristöoloihin. Lisäksi selvitämme, (iv) miten tylakoidikalvostojen säätelyn evoluutio on edennyt, ja erityisesti miten syanobakteerien flavodiiron-proteiinit ovat evoluution kuluessa korvautuneet muilla suojelujärjestelmillä, jotta ymmärtäisimme, miten yhteyttävä elämä aikoinaan pystyi siirtymään valtameristä kuivalle maalle.
Soveltava tutkimuksemme keskittyy hiilineutraalien biopolttoaineiden ja kemikaalien tuottamiseen elävissä solutehtaissa. Synteettisen biologian menetelmin muokkaamme syanobakteerien fotosynteesitehokkuutta poistaen säätelyn aiheuttamia pullonkauloja ja samalla lisäämme soluihin tarkoituksenmukaisia aineenvaihduntareittejä ”elektronisinkkien” vahvistamiseksi ja haluttujen kemikaalien sekä polttoaineiden tuottamiseksi. Solutehtaissa syanobakteerit toimivat katalyytteinä paljon korkeammalla valonenergian hyödyntämistehokkuudella kuin niillä luontaisesti on ja käyttävät raaka-aineinaan pääasiassa vain auringon valoa, hiilidioksidia ja vettä. Soveltava tutkimuksemme nojaa voimakkaasti tekemäämme perustutkimukseen, sillä valoenergian talteenoton ja elektroninsiirtoketjun säätelyn ymmärtäminen on erityisen tärkeää näiden reaktioiden tehostamiseksi tulevaisuuden solutehtaissa.
- The FKBP families of higher plants: Exploring the structures and functions of protein interaction specialists (2012)
- FEBS Letters
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Thylakoid protein phosphorylation in dynamic regulation of photosystem II in higher plants (2012)
- BBA - Bioenergetics
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - A chloroplast-targeted DnaJ protein AtJ8 is negatively regulated by light and has rapid turnover in darkness (2011)
- Journal of Plant Physiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Analysis of thylakoid protein complexes by two-dimensional electrophoretic systems (2011) Chloroplast Research in Arabidopsis, Volume II: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology Sari Sirpiö, Marjaana Suorsa, Eva-Mari Aro
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - Comparative metagenomics of microbial traits within oceanic viral communities (2011)
- ISME Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Cyanobacterial NDH-1 complexes: Novel insights and remaining puzzles (2011)
- BBA - Bioenergetics
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Electron paramagnetic resonance study of the electron transfer reactions in photosystem II membrane preparations from Arabidopsis thaliana (2011)
- BBA - Bioenergetics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Identification of new protein complexes of Escherichia coli inorganic pyrophosphatase using pull-down assay (2011)
- Biochimie
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Identification of Novel Ssl0352 Protein (NdhS), Essential for Efficient Operation of Cyclic Electron Transport around Photosystem I, in NADPH:plastoquinone Oxidoreductase (NDH-1) Complexes of Synechocystis sp. PCC 6803 (2011)
- Journal of Biological Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Interplay between Flavodiiron Proteins and Photorespiration in Synechocystis sp. PCC 6803 (2011)
- Journal of Biological Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Knock-down of protein phosphatase 2A subunit B'γ promotes phosphorylation of CALRETICULIN 1 in Arabidopsis thaliana (2011)
- Plant Signaling and Behavior
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Marine cyanophages: tinkering with the electron transport chain (2011)
- ISME Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Membrane attachment of Slr0006 in Synechocystis sp PCC 6803 is determined by divalent ions (2011)
- Photosynthesis Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Novel insights into plant light-harvesting complex II phosphorylation and 'state transitions' (2011)
- Trends in Plant Science
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Optimized native gel systems for separation of thylakoid protein complexes: novel super- and mega-complexes (2011)
- Biochemical Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Reconstructing a puzzle: existence of cyanophages containing both photosystem-I and photosystem-II gene suites inferred from oceanic metagenomic datasets (2011)
- Environmental Microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Regulatory Subunit B ' gamma of Protein Phosphatase 2A Prevents Unnecessary Defense Reactions under Low Light in Arabidopsis (2011)
- Plant Physiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Structure and Physiological Function of NDH-1 Complexes in Cyanobacteria (2011) Bioenergetic Processes of Cyanobacteria - From Evolutionary Singularity to Ecological Diversity Battchikova N, Aro E-M, Nixon PJ
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - Structure of the Chloroplast NADH Dehydrogenase-Like Complex: Nomenclature for Nuclear-Encoded Subunits (2011)
- Plant and Cell Physiology
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - The Thylakoid Membrane Proteome of Two Marine Diatoms Outlines Both Diatom-Specific and Species-Specific Features of the Photosynthetic Machinery (2011)
- Journal of Proteome Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )