Sampo Pyysalo


apulaisprofessori ii vaihe, Kieli- ja puheteknologia (Tulevaisuuden teknologioiden laitos)

sampo.pyysalo@utu.fi







Julkaisut

CoNLL 2017 Shared Task: Multilingual Parsing from Raw Text to Universal Dependencies (2017) Proceedings of the CoNLL 2017 Shared Task: Multilingual Parsing from Raw Text to Universal Dependencies Zeman D, Popel M, Straka M, Hajič J, Nivre J, Ginter F, Luotolahti J, Pyysalo S, Petrov S, Potthast M, Tyers F, Badmaeva E, Gökırmak M, Nedoluzhko A, Cinková S, Hajič jr. J, Hlaváčová J, Kettnerová V, Urešová Z, Kanerva J, Ojala S, Missilä A, Manning C, Schuster S, Reddy S, Taji D, Habash N, Leung H, Marneffe M, Sanguinetti M, Simi M, Kanayama H, Paiva V, Droganova K, Martínez Alonso H, Uszkoreit H, Macketanz V, Burchardt A, Harris K, Marheinecke K, Rehm G, Kayadelen T, Attia M, Elkahky A, Yu Z, Pitler E, Lertpradit S, Mandl M, Kirchner J, Fernandez Alcalde H, Strnadova J, Banerjee E, Manurung R, Stella A, Shimada A, Kwak S, Mendonçca G, Lando T, Nitisaroj R, Li J
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)

Cell line name recognition in support of the identification of synthetic lethality in cancer from text – Cell line name recognition (2016)
Bioinformatics
Suwisa Kaewphan, Sofie Van Landeghem, Tomoko Ohta, Yves Van de Peer, Filip Ginter, Sampo Pyysalo
(
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä)

Deep Learning With Minimal Training Data: TurkuNLP Entry in the BioNLP Shared Task 2016 (2016) Proceedings of the 4th BioNLP Shared Task Workshop Farrokh Mehryary, Jari Bjorne, Sampo Pyysalo, Tapio Salakoski, Filip Ginter
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)

Overview of the Cancer Genetics and Pathway Curation tasks of BioNLP Shared Task 2013 (2015)
BMC Bioinformatics
Pyysalo S, Ohta T, Rak R, Rowley A, Chun HW, Jung SJ, Choi SP, Tsujii J, Ananiadou S
(
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä)

SETS: Scalable and Efficient Tree Search in Dependency Graphs (2015) Proceedings of the 2015 Conference of the North American Chapter of the Association for Computational Linguistics: Demonstrations Juhani Luotolahti, Jenna Kanerva, Sampo Pyysalo, Filip Ginter
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)

Sharing annotations better: RESTful Open Annotation (2015) Proceedings of ACL-IJCNLP 2015 System Demonstrations Pyysalo Sampo, Campos Jorge, Cejuela Juan Miguel, Ginter Filip, Hakala Kai, Li Chen, Stenetorp Pontus, Jensen Lars Juhl
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)

Towards the Classification of the Finnish Internet Parsebank: Detecting Translations and Informality (2015) 20th Nordic Conference of Computational Linguistics (Nodalida 2015) Laippala Veronika, Kanerva Jenna, Pyysalo Sampo, Missilä Anna, Salakoski Tapio, Ginter Filip
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)

Towards Universal Web Parsebanks (2015) Proceedings of the International Conference on Dependency Linguistics (Depling'15) Juhani Luotolahti, Jenna Kanerva, Veronika Laippala, Sampo Pyysalo , Filip Ginter
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)

Universal Dependencies for Finnish (2015) Proceedings of the 20th Nordic Conference of Computational Linguistics (NODALIDA 2015) Sampo Pyysalo, Jenna Kanerva, Anna Missilä, Veronika Laippala, Filip Ginter
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)

Distributional Semantic Resources for Biomedical Text Processing (2013) Proceedings of the 5th International Symposium on Languages in Biology and Medicine (LBM '13) Pyysalo Sampo, Ginter Filip, Moen Hans, Salakoski Tapio, Ananiadou Sophia
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)

Large-scale event extraction from literature with multi-level gene normalization (2013)
PLoS ONE
Van Landeghem Sofie, Björne Jari, Wei Chih-Hsuan, Hakala Kai, Pyysalo Sampo, Ananiadou Sophia, Kao Hung-Yu, Lu Zhiyong, Salakoski Tapio, Van de Peer Yves, Ginter Filip
(
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä)

Matrix representations, linear transformations, and kernels for disambiguation in natural language (2009)
Machine Learning
Pahikkala T, Pyysalo S, Boberg J, Jarvinen J, Salakoski T
(
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä)

A Graph Kernel for Protein-Protein Interaction Extraction (2008) Proceedings of the Workshop on Current Trends in Biomedical Natural Language Processing (BioNLP 2008) Airola A, Pyysalo S, Björne J, Pahikkala T, Ginter F, Salakoski T
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)

Comparative analysis of five protein-protein interaction corpora (2008)
BMC Bioinformatics
Pyysalo S, Airola A, Heimonen J, Bjorne J, Ginter F, Salakoski T
(
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä)

Machine Learning to Automate the Assignment of Diagnosis Codes to Free-text Radiology Reports: a Method Description (2008) Proceedings of the ICML/UAI workshop on Machine Learning in health care applications Suominen H, Ginter F, Pyysalo S, Airola A, Pahikkala T, Salanterä S, Salakoski T
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)

Regularized Least-Squares for parse ranking (2005)
Lecture Notes in Computer Science
Proceedings of the 6th International Symposium on Intelligent Data Analysis Tsivtsivadze E, Pahikkala T, Pyysalo S, Boberg J, Myllari A, Salakoski T
(
A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa)


Last updated on 2017-17-11 at 02:47